Naruto a történet főhőse. A célja, hogy ő lesz a falu hőse a Hokage. A falusiak kerülik és nem ismerik el amiért a rókadémon hordozója a Jinchuuriki. De Naruto ennek ellenére vidám és féktelen természetével ellensúlyozza ezt a problémát. A történet során sok falubeli és idegen falubeli ninjával összebarátkozik és egy nagyon erős köteléket hoz létre velük. Kapcsolata különösen szorosra, testvérire fonódik egyik csapattársával, Uchiha Sasukéval.